แฮมสเตอร์ในธรรมชาติกินอาหารที่เป็นทั้งพืชและสัตว์จำพวกแมลงต่างๆและไส้เดือนส่วนแฮมสเตอร์ที่เป็นสัตว์เลี้ยงได้รับอาหารจำพวกพืชเท่านั้นเราจึงต้องให้อาหารที่มีคุณค่าครบตามความต้องการของร่างกายเล็ก ๆ ของมัน

แฮมสเตอร์มีฟัน 16 ซี่ซึ่งมีรูปร่างพิเศษสำหรับการกัดแทะและบดเคี้ยวอาหารและมีฟันแหลมคมคู่หน้าอีกด้วยนอกจากนี้มันยังมีกระพุ้งแก้มใหญ่ที่สามารถเก็บรวบรวมอาหารได้เป็นจำนวนมากซึ่งเป็นประโยชน์ในการขนอาหารจากที่ต่างๆไปไว้ในรังเมื่อกลับถึงรังมันจะใช้ขาคู่หน้าช่วยดันอาหารที่อมไว้ 2 ข้างแก้มออกมา